Repetibilidade de marcadores RAPD em germoplasma de tucumã-do-pará.
Marcadores RAPD, apesar de terem baixo custo, serem de fácil aplicação e aleatórios permitindo seus usos em qualquer espécie, são relatados como tendo baixa repetibilidade dos resultados, ocasionados por vários fatores, como a variação entre termocicladores. O tucumã-do-pará (Astrocaryum vulgare Mart.), palmeira nativa da Amazônia, tem forte ocorrência e utilidade no lado Oriental, cujo germoplasma tem sido pouco estudado. Assim, avaliou-se a repetibilidade do padrão de amplificação de marcadores RAPD em germoplasma de tucumã-do-pará. Foram utilizadas cinco amostras de DNA de tucumã-do-pará, conservadas sob baixa temperatura no laboratório de genética molecular da Embrapa Amazônia Oriental, em testes de amplificação de cinco primers RAPD. As reações de PCR foram repetidas três vezes no mesmo termociclador para a comprovação da confiabilidade dos dados gerados, tendo-se o cuidado de manter as mesmas concentrações dos componentes de preparo das reações para minimizar erros. Os géis foram usados na contagem da ausência e presença de banda para o cálculo da taxa de repetibilidade. Foi detectado em todos os primers um padrão de amplificação possível de ser codificado. Os marcadores produziram 28,6% de bandas que não se repetiram. A repetição por primer foi alta, variando de 50,3% a 100% e com médias de 61,3% (OPAB-01) a 93,9% (OPA-14). A repetibilidade de marcadores RAPD em germoplasma de tucumã-do-pará pode ser considerada alta, com um padrão de amplificação possível de ser codificado. Logo, podem ser usados na caracterização genética dessa espécie.
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2013-02-22
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dig-alice-doc-9505912017-08-15T23:12:12Z Repetibilidade de marcadores RAPD em germoplasma de tucumã-do-pará. ROSAS, M. R. OLIVEIRA, M. do S. P. de SANCHES, E. de N. M. OLIVEIRA, N. P. de MOISES ROSAS ROSAS, UFPA; MARIA DO SOCORRO P DE OLIVEIRA, CPATU; ELICIANY DE NAZARÉ MIRANDA SANCHES, UFRA; NATALIA PADILHA DE OLIVEIRA, UFLA. Tucumã Palmeira nativa. Astrocaryum vulgare Marcador Molecular. Amazonia. Marcadores RAPD, apesar de terem baixo custo, serem de fácil aplicação e aleatórios permitindo seus usos em qualquer espécie, são relatados como tendo baixa repetibilidade dos resultados, ocasionados por vários fatores, como a variação entre termocicladores. O tucumã-do-pará (Astrocaryum vulgare Mart.), palmeira nativa da Amazônia, tem forte ocorrência e utilidade no lado Oriental, cujo germoplasma tem sido pouco estudado. Assim, avaliou-se a repetibilidade do padrão de amplificação de marcadores RAPD em germoplasma de tucumã-do-pará. Foram utilizadas cinco amostras de DNA de tucumã-do-pará, conservadas sob baixa temperatura no laboratório de genética molecular da Embrapa Amazônia Oriental, em testes de amplificação de cinco primers RAPD. As reações de PCR foram repetidas três vezes no mesmo termociclador para a comprovação da confiabilidade dos dados gerados, tendo-se o cuidado de manter as mesmas concentrações dos componentes de preparo das reações para minimizar erros. Os géis foram usados na contagem da ausência e presença de banda para o cálculo da taxa de repetibilidade. Foi detectado em todos os primers um padrão de amplificação possível de ser codificado. Os marcadores produziram 28,6% de bandas que não se repetiram. A repetição por primer foi alta, variando de 50,3% a 100% e com médias de 61,3% (OPAB-01) a 93,9% (OPA-14). A repetibilidade de marcadores RAPD em germoplasma de tucumã-do-pará pode ser considerada alta, com um padrão de amplificação possível de ser codificado. Logo, podem ser usados na caracterização genética dessa espécie. 2013-02-22T11:11:11Z 2013-02-22T11:11:11Z 2013-02-22 2012 2013-02-22T11:11:11Z Parte de livro In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/950591 pt_BR por openAccess 1 CD-ROM. |
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