Identificação e análise de genes expressos em semente e polpa de cupuaçuzeiro.
O cupuaçuzeiro, Theobroma grandiflorum (Willd. ex Spreng.) Schumm., é a segunda espécie mais importante para a fruticultura da região amazônica, com cerca de 10% do mercado de todas as frutas amazônicas. Apesar de sua importância econômica, pouco se conhece sobre a base genética desta planta, em particular, as bases moleculares. Este trabalho teve como objetivo identificar genes expressos em frutos de cupuaçuzeiro, para disponibilizar uma nova ferramenta de apoio aos trabalhos de melhoramento genético. RNA dos frutos foram obtidos e, após processamento, as sequências foram determinadas por pirosequenciamento, utilizando-se a plataforma 454 (Roche Applied Science). Para os processos de limpeza das sequências e obtenção dos contigs, foram utilizados os programas est2assembly e mira assembly. A busca por similaridade foi realizada utilizando o programa BLASTX contra o banco de dados de proteínas NR (não-redundante). Cerca de 6.200 contigs apresentaram similaridade com proteínas previamente descritas. Em seguida, foram selecionados alguns contigs com potencial para utilização nos programas de melhoramento vegetal. Dentre eles, 20 foram similares a proteínas descritas para o gênero Theobroma e 6 para outros gêneros. As sequências selecionadas são relacionadas a genes codificadores de proteínas de reserva, de resposta a estresse, da via de síntese de ácidos graxos, etc. Análises mais aprofundadas das sequências permitirão a construção de uma importante base de dados moleculares para esta cultura.
| Main Authors: | , , , , , , |
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| Format: | Parte de livro biblioteca |
| Language: | pt_BR por |
| Published: |
2013-02-21
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| Subjects: | Expressão gênica, Transcriptoma., Cupuaçu, Theobroma Grandiflorum., |
| Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/950301 |
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