Efeitos da taxa de recombinação e frequência gênica sobre a eficiência para detectar ligação entre marcador genético e um locus de uma característica quantitativa (QTL).
Com o objetivo de se avaliar os efeitos da taxa de recombinação (r) e a frequência gênica (p) sobre a eficiência de se detectar ligação entre marcador e QTL foram simulados diversas populações de meio-irmãs. Os resultados indicam que a frequência gênica tem um grande efeito sobre a eficiência. Para p = 0,5 foram necessários 4.000 genótipos para se obter uma potência de 90% e 32.000 genótipos se p for igual a 0,1. A taxa de recombinação diferente de zero reduziu consideravelmente a eficiência. Em geral,para se manter a mesma eficiência quando r é diferente de zero, são necessários medir 1/(1-2r)**2 mais animais.
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| Other Authors: | |
| Format: | Artigo em anais e proceedings biblioteca |
| Language: | por |
| Published: |
1997-07-21
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| Subjects: | Analise de ligacao, Frequencia genica, Marcadores geneticos, QTL, Taxa de recombinacao, Linkage, Power, Recombination rate, gene frequency, genetic markers, |
| Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/592491 |
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| Summary: | Com o objetivo de se avaliar os efeitos da taxa de recombinação (r) e a frequência gênica (p) sobre a eficiência de se detectar ligação entre marcador e QTL foram simulados diversas populações de meio-irmãs. Os resultados indicam que a frequência gênica tem um grande efeito sobre a eficiência. Para p = 0,5 foram necessários 4.000 genótipos para se obter uma potência de 90% e 32.000 genótipos se p for igual a 0,1. A taxa de recombinação diferente de zero reduziu consideravelmente a eficiência. Em geral,para se manter a mesma eficiência quando r é diferente de zero, são necessários medir 1/(1-2r)**2 mais animais. |
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