Otimização de Protocolo de ISSR para Caracterização Molecular de Acessos de Pinhão-manso.
O Pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma oleaginosa que se destaca pelo seu potencial para a produção de biodiesel. Uma abordagem por meio de marcadores moleculares para análise de variabilidade genética contribuirá no processo de melhoramento dessa espécie. Para tanto necessitam que suas reações de amplificação com primers ISSR (Intersimple Sequence Repeats) sejam estabilizadas, para que possam ter boa reprodutibilidade dos resultados. Esse trabalho teve como objetivo otimizar o protocolo de amplificação de marcadores ISSR para posterior caracterização molecular dos acessos de pinhão-manso. Ao analisar os efeitos gerados pelas modificações na reação de amplificação, verificou-se diferenças nos produtos de PCR gerados. Definiu-se melhor padrão de bandas na reação com: Tampão 1X [20 mM Tris-HCl pH 8,0; 0,1 mM EDTA; 1,0 mM DTT; 50% (v/v) glicerol]; MgCl2 a 3,0 mM; dNTP a 800 ?M; 1,2 pMol de primer, 1 U de Taq DNA polimerase, 1 ?l de DNA genômico (~15 ng) e 48°C para temperatura de anelamento. Com a continuação desse trabalho, a seleção de primers capazes de identificar loci polimórficos na espécie constitui-se em uma importante ferramenta para estudos de diversidade genética e caracterização molecular do pinhão-manso.
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Published: |
2010-01-06
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Subjects: | Diversidade genética, Espécie oleaginosa, Marcador Molecular, |
Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/579783 |
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dig-alice-doc-5797832023-08-29T18:23:33Z Otimização de Protocolo de ISSR para Caracterização Molecular de Acessos de Pinhão-manso. AGUIAR, B. G. A. SOUZA, I. G. B. de SANTOS, M. F. dos LIMA, P. S. da C. BRUNO GUEDES ALCOFORADO AGUIAR, Faculdade NOVAFAPI; ISIS GOMES BRITO DE SOUZA, UFPI; MICHELLI FERREIRA DOS SANTOS, UFPI; PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA, CPAMN. Diversidade genética Espécie oleaginosa Marcador Molecular O Pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma oleaginosa que se destaca pelo seu potencial para a produção de biodiesel. Uma abordagem por meio de marcadores moleculares para análise de variabilidade genética contribuirá no processo de melhoramento dessa espécie. Para tanto necessitam que suas reações de amplificação com primers ISSR (Intersimple Sequence Repeats) sejam estabilizadas, para que possam ter boa reprodutibilidade dos resultados. Esse trabalho teve como objetivo otimizar o protocolo de amplificação de marcadores ISSR para posterior caracterização molecular dos acessos de pinhão-manso. Ao analisar os efeitos gerados pelas modificações na reação de amplificação, verificou-se diferenças nos produtos de PCR gerados. Definiu-se melhor padrão de bandas na reação com: Tampão 1X [20 mM Tris-HCl pH 8,0; 0,1 mM EDTA; 1,0 mM DTT; 50% (v/v) glicerol]; MgCl2 a 3,0 mM; dNTP a 800 ?M; 1,2 pMol de primer, 1 U de Taq DNA polimerase, 1 ?l de DNA genômico (~15 ng) e 48°C para temperatura de anelamento. Com a continuação desse trabalho, a seleção de primers capazes de identificar loci polimórficos na espécie constitui-se em uma importante ferramenta para estudos de diversidade genética e caracterização molecular do pinhão-manso. 2023-08-29T18:23:33Z 2023-08-29T18:23:33Z 2010-01-06 2009 Artigo em anais e proceedings In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 26., 2009, Gramado. Agricultura forte: alimento, energia e meio ambiente. Gramado: CONFAEAB: SARGS, 2009. Ref. T108 http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/579783 Portugues pt_BR openAccess 4 p. |
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O Pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma oleaginosa que se destaca pelo seu potencial para a produção de biodiesel. Uma abordagem por meio de marcadores moleculares para análise de variabilidade genética contribuirá no processo de melhoramento dessa espécie. Para tanto necessitam que suas reações de amplificação com primers ISSR (Intersimple Sequence Repeats) sejam estabilizadas, para que possam ter boa reprodutibilidade dos resultados. Esse trabalho teve como objetivo otimizar o protocolo de amplificação de marcadores ISSR para posterior caracterização molecular dos acessos de pinhão-manso. Ao analisar os efeitos gerados pelas modificações na reação de amplificação, verificou-se diferenças nos produtos de PCR gerados. Definiu-se melhor padrão de bandas na reação com: Tampão 1X [20 mM Tris-HCl pH 8,0; 0,1 mM EDTA; 1,0 mM DTT; 50% (v/v) glicerol]; MgCl2 a 3,0 mM; dNTP a 800 ?M; 1,2 pMol de primer, 1 U de Taq DNA polimerase, 1 ?l de DNA genômico (~15 ng) e 48°C para temperatura de anelamento. Com a continuação desse trabalho, a seleção de primers capazes de identificar loci polimórficos na espécie constitui-se em uma importante ferramenta para estudos de diversidade genética e caracterização molecular do pinhão-manso. |
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