Otimização de Protocolo de ISSR para Caracterização Molecular de Acessos de Pinhão-manso.

O Pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma oleaginosa que se destaca pelo seu potencial para a produção de biodiesel. Uma abordagem por meio de marcadores moleculares para análise de variabilidade genética contribuirá no processo de melhoramento dessa espécie. Para tanto necessitam que suas reações de amplificação com primers ISSR (Intersimple Sequence Repeats) sejam estabilizadas, para que possam ter boa reprodutibilidade dos resultados. Esse trabalho teve como objetivo otimizar o protocolo de amplificação de marcadores ISSR para posterior caracterização molecular dos acessos de pinhão-manso. Ao analisar os efeitos gerados pelas modificações na reação de amplificação, verificou-se diferenças nos produtos de PCR gerados. Definiu-se melhor padrão de bandas na reação com: Tampão 1X [20 mM Tris-HCl pH 8,0; 0,1 mM EDTA; 1,0 mM DTT; 50% (v/v) glicerol]; MgCl2 a 3,0 mM; dNTP a 800 ?M; 1,2 pMol de primer, 1 U de Taq DNA polimerase, 1 ?l de DNA genômico (~15 ng) e 48°C para temperatura de anelamento. Com a continuação desse trabalho, a seleção de primers capazes de identificar loci polimórficos na espécie constitui-se em uma importante ferramenta para estudos de diversidade genética e caracterização molecular do pinhão-manso.

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: AGUIAR, B. G. A., SOUZA, I. G. B. de, SANTOS, M. F. dos, LIMA, P. S. da C.
Other Authors: BRUNO GUEDES ALCOFORADO AGUIAR, Faculdade NOVAFAPI; ISIS GOMES BRITO DE SOUZA, UFPI; MICHELLI FERREIRA DOS SANTOS, UFPI; PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA, CPAMN.
Format: Artigo em anais e proceedings biblioteca
Language:Portugues
pt_BR
Published: 2010-01-06
Subjects:Diversidade genética, Espécie oleaginosa, Marcador Molecular,
Online Access:http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/579783
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
id dig-alice-doc-579783
record_format koha
spelling dig-alice-doc-5797832023-08-29T18:23:33Z Otimização de Protocolo de ISSR para Caracterização Molecular de Acessos de Pinhão-manso. AGUIAR, B. G. A. SOUZA, I. G. B. de SANTOS, M. F. dos LIMA, P. S. da C. BRUNO GUEDES ALCOFORADO AGUIAR, Faculdade NOVAFAPI; ISIS GOMES BRITO DE SOUZA, UFPI; MICHELLI FERREIRA DOS SANTOS, UFPI; PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA, CPAMN. Diversidade genética Espécie oleaginosa Marcador Molecular O Pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma oleaginosa que se destaca pelo seu potencial para a produção de biodiesel. Uma abordagem por meio de marcadores moleculares para análise de variabilidade genética contribuirá no processo de melhoramento dessa espécie. Para tanto necessitam que suas reações de amplificação com primers ISSR (Intersimple Sequence Repeats) sejam estabilizadas, para que possam ter boa reprodutibilidade dos resultados. Esse trabalho teve como objetivo otimizar o protocolo de amplificação de marcadores ISSR para posterior caracterização molecular dos acessos de pinhão-manso. Ao analisar os efeitos gerados pelas modificações na reação de amplificação, verificou-se diferenças nos produtos de PCR gerados. Definiu-se melhor padrão de bandas na reação com: Tampão 1X [20 mM Tris-HCl pH 8,0; 0,1 mM EDTA; 1,0 mM DTT; 50% (v/v) glicerol]; MgCl2 a 3,0 mM; dNTP a 800 ?M; 1,2 pMol de primer, 1 U de Taq DNA polimerase, 1 ?l de DNA genômico (~15 ng) e 48°C para temperatura de anelamento. Com a continuação desse trabalho, a seleção de primers capazes de identificar loci polimórficos na espécie constitui-se em uma importante ferramenta para estudos de diversidade genética e caracterização molecular do pinhão-manso. 2023-08-29T18:23:33Z 2023-08-29T18:23:33Z 2010-01-06 2009 Artigo em anais e proceedings In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 26., 2009, Gramado. Agricultura forte: alimento, energia e meio ambiente. Gramado: CONFAEAB: SARGS, 2009. Ref. T108 http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/579783 Portugues pt_BR openAccess 4 p.
institution EMBRAPA
collection DSpace
country Brasil
countrycode BR
component Bibliográfico
access En linea
databasecode dig-alice
tag biblioteca
region America del Sur
libraryname Sistema de bibliotecas de EMBRAPA
language Portugues
pt_BR
topic Diversidade genética
Espécie oleaginosa
Marcador Molecular
Diversidade genética
Espécie oleaginosa
Marcador Molecular
spellingShingle Diversidade genética
Espécie oleaginosa
Marcador Molecular
Diversidade genética
Espécie oleaginosa
Marcador Molecular
AGUIAR, B. G. A.
SOUZA, I. G. B. de
SANTOS, M. F. dos
LIMA, P. S. da C.
Otimização de Protocolo de ISSR para Caracterização Molecular de Acessos de Pinhão-manso.
description O Pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma oleaginosa que se destaca pelo seu potencial para a produção de biodiesel. Uma abordagem por meio de marcadores moleculares para análise de variabilidade genética contribuirá no processo de melhoramento dessa espécie. Para tanto necessitam que suas reações de amplificação com primers ISSR (Intersimple Sequence Repeats) sejam estabilizadas, para que possam ter boa reprodutibilidade dos resultados. Esse trabalho teve como objetivo otimizar o protocolo de amplificação de marcadores ISSR para posterior caracterização molecular dos acessos de pinhão-manso. Ao analisar os efeitos gerados pelas modificações na reação de amplificação, verificou-se diferenças nos produtos de PCR gerados. Definiu-se melhor padrão de bandas na reação com: Tampão 1X [20 mM Tris-HCl pH 8,0; 0,1 mM EDTA; 1,0 mM DTT; 50% (v/v) glicerol]; MgCl2 a 3,0 mM; dNTP a 800 ?M; 1,2 pMol de primer, 1 U de Taq DNA polimerase, 1 ?l de DNA genômico (~15 ng) e 48°C para temperatura de anelamento. Com a continuação desse trabalho, a seleção de primers capazes de identificar loci polimórficos na espécie constitui-se em uma importante ferramenta para estudos de diversidade genética e caracterização molecular do pinhão-manso.
author2 BRUNO GUEDES ALCOFORADO AGUIAR, Faculdade NOVAFAPI; ISIS GOMES BRITO DE SOUZA, UFPI; MICHELLI FERREIRA DOS SANTOS, UFPI; PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA, CPAMN.
author_facet BRUNO GUEDES ALCOFORADO AGUIAR, Faculdade NOVAFAPI; ISIS GOMES BRITO DE SOUZA, UFPI; MICHELLI FERREIRA DOS SANTOS, UFPI; PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA, CPAMN.
AGUIAR, B. G. A.
SOUZA, I. G. B. de
SANTOS, M. F. dos
LIMA, P. S. da C.
format Artigo em anais e proceedings
topic_facet Diversidade genética
Espécie oleaginosa
Marcador Molecular
author AGUIAR, B. G. A.
SOUZA, I. G. B. de
SANTOS, M. F. dos
LIMA, P. S. da C.
author_sort AGUIAR, B. G. A.
title Otimização de Protocolo de ISSR para Caracterização Molecular de Acessos de Pinhão-manso.
title_short Otimização de Protocolo de ISSR para Caracterização Molecular de Acessos de Pinhão-manso.
title_full Otimização de Protocolo de ISSR para Caracterização Molecular de Acessos de Pinhão-manso.
title_fullStr Otimização de Protocolo de ISSR para Caracterização Molecular de Acessos de Pinhão-manso.
title_full_unstemmed Otimização de Protocolo de ISSR para Caracterização Molecular de Acessos de Pinhão-manso.
title_sort otimização de protocolo de issr para caracterização molecular de acessos de pinhão-manso.
publishDate 2010-01-06
url http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/579783
work_keys_str_mv AT aguiarbga otimizacaodeprotocolodeissrparacaracterizacaomoleculardeacessosdepinhaomanso
AT souzaigbde otimizacaodeprotocolodeissrparacaracterizacaomoleculardeacessosdepinhaomanso
AT santosmfdos otimizacaodeprotocolodeissrparacaracterizacaomoleculardeacessosdepinhaomanso
AT limapsdac otimizacaodeprotocolodeissrparacaracterizacaomoleculardeacessosdepinhaomanso
_version_ 1775947813518049280