Caracterização da resposta de Gliricidia sepium (JACQ.) STEUD. ao estresse salino mediante emprego da proteômica e metabolômica.
A população mundial está aumentando rapidamente ao longo dos anos e será necessário produzir aproximadamente 90% a mais de culturas alimentares do que estamos produzindo hoje, especialmente grãos, para suprir tal demanda até 2050 (REDDY et al., 2017). No entanto, o estresse abiótico, que inclui o sal, ameaça severamente a produção agrícola e causa perdas significativa de rendimento em grandes áreas (OSAKABE; OSAKABE, 2012). Desta forma, o objetivo geral do presente estudo foi aplicar estratégias de análise do metabolôma e do proteôma de folhas e raízes de plantas jovens de Gliricidia sepium, submetidas ou não a alto nível de estresse salino (>25 dS m-1), visando adquirir conhecimentos sobre os mecanismos moleculares envolvidos na tolerância desta espécie à salinidade. Portanto, foram utilizados dados do banco de dados “Sal da Terra”, pertencentes ao programa de PD&I de mesmo nome desenvolvido na Embrapa Agroenergia, que abriga dados de fenômica, ionômica, genômica, transcritômica (mRNA e microRNA), metabolômica e proteômica caracterizando a resposta de dendê (Elaeis guineensis), beldroega (Portulaca oleracea) e gliricídia (Gliricidia sepium) ao estresse salino. As amostras de metaboloma foram analisadas em um sistema UHPLC equipado com uma coluna de fase reversa. A espectrometria de massa de alta resolução (HRMS) foi realizada em um analisador Q-TOF usando fonte de eletrospray em ESI (+) - MS e ESI (-) - MS. Os dados adquiridos foram pré-processados usando o XCMS Online e posteriormente exportados para o MetaboAnalyst para análises estatísticas, anotação e observação das vias metabólicas. As amostras de proteoma foram preparadas e submetidas a análises LC – MS/MS pela empresa GenOne (Rio de Janeiro, RJ, Brasil), utilizou uma abordagem de quantificação “label-free”, e os dados foram adquiridos usando o software Xcalibur e posteriormente exportados para o PatternLab para as análises quantitativas e qualitativas. Os resultados alcançados permitiram identificar proteínas e metabólitos, e vias metabólicas, responsivas a este estresse, tanto nas folhas quanto nas raízes.
| Main Author: | |
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| Other Authors: | |
| Format: | Teses biblioteca |
| Language: | Portugues pt_BR |
| Published: |
2022-05-10
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| Subjects: | Metabolômica, Proteômica, Salinidade, |
| Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1142809 |
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| Summary: | A população mundial está aumentando rapidamente ao longo dos anos e será necessário produzir aproximadamente 90% a mais de culturas alimentares do que estamos produzindo hoje, especialmente grãos, para suprir tal demanda até 2050 (REDDY et al., 2017). No entanto, o estresse abiótico, que inclui o sal, ameaça severamente a produção agrícola e causa perdas significativa de rendimento em grandes áreas (OSAKABE; OSAKABE, 2012). Desta forma, o objetivo geral do presente estudo foi aplicar estratégias de análise do metabolôma e do proteôma de folhas e raízes de plantas jovens de Gliricidia sepium, submetidas ou não a alto nível de estresse salino (>25 dS m-1), visando adquirir conhecimentos sobre os mecanismos moleculares envolvidos na tolerância desta espécie à salinidade. Portanto, foram utilizados dados do banco de dados “Sal da Terra”, pertencentes ao programa de PD&I de mesmo nome desenvolvido na Embrapa Agroenergia, que abriga dados de fenômica, ionômica, genômica, transcritômica (mRNA e microRNA), metabolômica e proteômica caracterizando a resposta de dendê (Elaeis guineensis), beldroega (Portulaca oleracea) e gliricídia (Gliricidia sepium) ao estresse salino. As amostras de metaboloma foram analisadas em um sistema UHPLC equipado com uma coluna de fase reversa. A espectrometria de massa de alta resolução (HRMS) foi realizada em um analisador Q-TOF usando fonte de eletrospray em ESI (+) - MS e ESI (-) - MS. Os dados adquiridos foram pré-processados usando o XCMS Online e posteriormente exportados para o MetaboAnalyst para análises estatísticas, anotação e observação das vias metabólicas. As amostras de proteoma foram preparadas e submetidas a análises LC – MS/MS pela empresa GenOne (Rio de Janeiro, RJ, Brasil), utilizou uma abordagem de quantificação “label-free”, e os dados foram adquiridos usando o software Xcalibur e posteriormente exportados para o PatternLab para as análises quantitativas e qualitativas. Os resultados alcançados permitiram identificar proteínas e metabólitos, e vias metabólicas, responsivas a este estresse, tanto nas folhas quanto nas raízes. |
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