Diversidade e estrutura genética de Swietenia macrophylla King em floresta manejada na Amazônia sul-ocidental.

Swietenia macrophylla King é uma espécie monoica, alógama, e ameaçada de extinção com alto valor econômico para a indústria madeireira. O objetivo desse estudo foi conhecer a diversidade e estrutura genética de Swietenia macrophylla King em floresta manejada na Amazônia Sul-Ocidental. Foram coletados material vegetal de 83 indivíduos adultos e 187 juvenis. Foram testatos 12 marcadores microssatélites para a caracterização da diversidade e estruturação genética espacial. Foi realizada a análise de parentesco pela determinação dos padrões de fluxo de pólen e distância de dispersão. Foi estimada a taxa efetiva de autofecundação, a taxa de cruzamento de indivíduos aparentados e não aparentados. Foi avaliado o sistema reprodutivo da espécie com base no método numérico Expectativa-Maximização (EM). Um total de 83 alelos foram encontrados nos adultos e 76 nos juvenis. A riqueza alélica (Rs) foi maior nos adultos (9,0) que nos juvenis (7,8). As médias de heterozigosidade observada (HO) e esperada (HE) para os indivíduos adultos foram de 0,975, 0,823, respectivamente. Para os juvenis os valores foram menores (HO = 0,751 e HE = 0,823), o que indica a perda da diversidade por deriva genética. O índice médio de fixação (F) foi significativo e negativo para os adultos (-0,185), indicando excesso de heterozigotos. Para os indivíduos juvenis, o valor de (F) também foi significativo e positivo (0,080) sugerindo a ocorrência de endogamia. A diferenciação genética (Gst) entre adultos e juvenis foi alta (0,260), o que também reforça a divergência entre as gerações. A análise de estruturação genética espacial para os indivíduos adultos foi significativa até 750 m, ou seja, a distribuição dos adultos não é aleatória e reflete a dispersão das sementes próximas a planta-mãe. A análise do sistema reprodutivo indicou alogamia com alta taxa de fecundação cruzada (tm = 0,995), e a ocorrência de cruzamentos entre indivíduos aparentados (tm ? ts = 0,058). Também foi observada a ocorrência de fluxo gênico entre 42 a 4.749 metros. O estudo indica perda da diversidade, endogamia, alta diferenciação genética entre as gerações e estruturação espacial dos adultos. Assim, estratégias de conservação são de extrema importância para evitar a extinção da espécie. Swietenia macrophylla King is a monoecious, allogenic, and endangered species with high economic value for the timber industry. The objective of this study was to study the diversity and genetic structure of Swietenia macrophylla King in a managed forest in the South Western Amazon. Plant material was collected from 83 adult individuals and 187 juveniles. Twelve microsatellite markers were used for the characterization of spatial genetic diversity and structuration. It was estimated the effective rate of self-fertilization, the rate of crossing of related and unrelated individuals and cross fertilization. The reproductive system of the species was evaluated based on the numerical Expectation-Maximization (EM) method. A total of 83 alleles were found in adults and 76 in juveniles. Allelic richness (Rs) was higher in adults (9.0) than in juveniles (7.8). The observed (HO) and expected (HE) heterozygosity averages for the adult subjects were 0.975, 0.823, respectively. For juveniles, the values were lower (HO = 0.751 and HE = 0.823), which indicates the loss of diversity due to genetic drift. The mean index of fixation (F) was significant and less than zero for adults (-0.185), indicating excess heterozygotes. For juveniles, the value of (F) was also significant, but it was higher than zero (0.080) suggesting the occurrence of inbreeding and crossbreeding among related individuals. The standard genetic differentiation (Gst) between adults and juveniles was significant and high (0.260), which also reinforces the divergence between generations. The analysis of spatial genetic structure for adult individuals was significant up to 750 m, that is, the distribution of adults is not random and reflects the dispersion of seeds close to the mother plant. The analysis of the reproductive system indicated alogamy with high cross - fertilization rate (tm = 0.995), and the occurrence of crosses between parenting individuals (tm - ts = 0.058). It was also observed the occurrence of gene flow between 42 and 4.749 meters. The study indicates loss of diversity, inbreeding, high genetic differentiation between generations and spatial structuring of adults. Thus, conservation strategies are extremely important to avoid extinction of the species.

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Bibliographic Details
Main Author: OLIVEIRA, S. S. de
Other Authors: Sabrina Silva de Oliveira, Universidade Federal do Acre (Ufac).
Format: Teses biblioteca
Language:pt_BR
pt_BR
Published: 2019-07-01
Subjects:Fitomejoramiento, Variación genética, Marcadores genéticos, Repeticiones de microsatélite, Amazônia Sul-Ocidental, Melhoramento Genético Vegetal, Variação Genética, Endogamia, Mogno, Swietenia Macrophylla, Marcador Molecular, Plant breeding, Genetic variation, Inbreeding, Genetic markers, Microsatellite repeats,
Online Access:http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110195
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Diversidade e estrutura genética de Swietenia macrophylla King em floresta manejada na Amazônia sul-ocidental.
description Swietenia macrophylla King é uma espécie monoica, alógama, e ameaçada de extinção com alto valor econômico para a indústria madeireira. O objetivo desse estudo foi conhecer a diversidade e estrutura genética de Swietenia macrophylla King em floresta manejada na Amazônia Sul-Ocidental. Foram coletados material vegetal de 83 indivíduos adultos e 187 juvenis. Foram testatos 12 marcadores microssatélites para a caracterização da diversidade e estruturação genética espacial. Foi realizada a análise de parentesco pela determinação dos padrões de fluxo de pólen e distância de dispersão. Foi estimada a taxa efetiva de autofecundação, a taxa de cruzamento de indivíduos aparentados e não aparentados. Foi avaliado o sistema reprodutivo da espécie com base no método numérico Expectativa-Maximização (EM). Um total de 83 alelos foram encontrados nos adultos e 76 nos juvenis. A riqueza alélica (Rs) foi maior nos adultos (9,0) que nos juvenis (7,8). As médias de heterozigosidade observada (HO) e esperada (HE) para os indivíduos adultos foram de 0,975, 0,823, respectivamente. Para os juvenis os valores foram menores (HO = 0,751 e HE = 0,823), o que indica a perda da diversidade por deriva genética. O índice médio de fixação (F) foi significativo e negativo para os adultos (-0,185), indicando excesso de heterozigotos. Para os indivíduos juvenis, o valor de (F) também foi significativo e positivo (0,080) sugerindo a ocorrência de endogamia. A diferenciação genética (Gst) entre adultos e juvenis foi alta (0,260), o que também reforça a divergência entre as gerações. A análise de estruturação genética espacial para os indivíduos adultos foi significativa até 750 m, ou seja, a distribuição dos adultos não é aleatória e reflete a dispersão das sementes próximas a planta-mãe. A análise do sistema reprodutivo indicou alogamia com alta taxa de fecundação cruzada (tm = 0,995), e a ocorrência de cruzamentos entre indivíduos aparentados (tm ? ts = 0,058). Também foi observada a ocorrência de fluxo gênico entre 42 a 4.749 metros. O estudo indica perda da diversidade, endogamia, alta diferenciação genética entre as gerações e estruturação espacial dos adultos. Assim, estratégias de conservação são de extrema importância para evitar a extinção da espécie. Swietenia macrophylla King is a monoecious, allogenic, and endangered species with high economic value for the timber industry. The objective of this study was to study the diversity and genetic structure of Swietenia macrophylla King in a managed forest in the South Western Amazon. Plant material was collected from 83 adult individuals and 187 juveniles. Twelve microsatellite markers were used for the characterization of spatial genetic diversity and structuration. It was estimated the effective rate of self-fertilization, the rate of crossing of related and unrelated individuals and cross fertilization. The reproductive system of the species was evaluated based on the numerical Expectation-Maximization (EM) method. A total of 83 alleles were found in adults and 76 in juveniles. Allelic richness (Rs) was higher in adults (9.0) than in juveniles (7.8). The observed (HO) and expected (HE) heterozygosity averages for the adult subjects were 0.975, 0.823, respectively. For juveniles, the values were lower (HO = 0.751 and HE = 0.823), which indicates the loss of diversity due to genetic drift. The mean index of fixation (F) was significant and less than zero for adults (-0.185), indicating excess heterozygotes. For juveniles, the value of (F) was also significant, but it was higher than zero (0.080) suggesting the occurrence of inbreeding and crossbreeding among related individuals. The standard genetic differentiation (Gst) between adults and juveniles was significant and high (0.260), which also reinforces the divergence between generations. The analysis of spatial genetic structure for adult individuals was significant up to 750 m, that is, the distribution of adults is not random and reflects the dispersion of seeds close to the mother plant. The analysis of the reproductive system indicated alogamy with high cross - fertilization rate (tm = 0.995), and the occurrence of crosses between parenting individuals (tm - ts = 0.058). It was also observed the occurrence of gene flow between 42 and 4.749 meters. The study indicates loss of diversity, inbreeding, high genetic differentiation between generations and spatial structuring of adults. Thus, conservation strategies are extremely important to avoid extinction of the species.
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Foram testatos 12 marcadores microssatélites para a caracterização da diversidade e estruturação genética espacial. Foi realizada a análise de parentesco pela determinação dos padrões de fluxo de pólen e distância de dispersão. Foi estimada a taxa efetiva de autofecundação, a taxa de cruzamento de indivíduos aparentados e não aparentados. Foi avaliado o sistema reprodutivo da espécie com base no método numérico Expectativa-Maximização (EM). Um total de 83 alelos foram encontrados nos adultos e 76 nos juvenis. A riqueza alélica (Rs) foi maior nos adultos (9,0) que nos juvenis (7,8). As médias de heterozigosidade observada (HO) e esperada (HE) para os indivíduos adultos foram de 0,975, 0,823, respectivamente. Para os juvenis os valores foram menores (HO = 0,751 e HE = 0,823), o que indica a perda da diversidade por deriva genética. O índice médio de fixação (F) foi significativo e negativo para os adultos (-0,185), indicando excesso de heterozigotos. Para os indivíduos juvenis, o valor de (F) também foi significativo e positivo (0,080) sugerindo a ocorrência de endogamia. A diferenciação genética (Gst) entre adultos e juvenis foi alta (0,260), o que também reforça a divergência entre as gerações. A análise de estruturação genética espacial para os indivíduos adultos foi significativa até 750 m, ou seja, a distribuição dos adultos não é aleatória e reflete a dispersão das sementes próximas a planta-mãe. A análise do sistema reprodutivo indicou alogamia com alta taxa de fecundação cruzada (tm = 0,995), e a ocorrência de cruzamentos entre indivíduos aparentados (tm ? ts = 0,058). Também foi observada a ocorrência de fluxo gênico entre 42 a 4.749 metros. O estudo indica perda da diversidade, endogamia, alta diferenciação genética entre as gerações e estruturação espacial dos adultos. Assim, estratégias de conservação são de extrema importância para evitar a extinção da espécie. Swietenia macrophylla King is a monoecious, allogenic, and endangered species with high economic value for the timber industry. The objective of this study was to study the diversity and genetic structure of Swietenia macrophylla King in a managed forest in the South Western Amazon. Plant material was collected from 83 adult individuals and 187 juveniles. Twelve microsatellite markers were used for the characterization of spatial genetic diversity and structuration. It was estimated the effective rate of self-fertilization, the rate of crossing of related and unrelated individuals and cross fertilization. The reproductive system of the species was evaluated based on the numerical Expectation-Maximization (EM) method. A total of 83 alleles were found in adults and 76 in juveniles. Allelic richness (Rs) was higher in adults (9.0) than in juveniles (7.8). The observed (HO) and expected (HE) heterozygosity averages for the adult subjects were 0.975, 0.823, respectively. For juveniles, the values were lower (HO = 0.751 and HE = 0.823), which indicates the loss of diversity due to genetic drift. The mean index of fixation (F) was significant and less than zero for adults (-0.185), indicating excess heterozygotes. For juveniles, the value of (F) was also significant, but it was higher than zero (0.080) suggesting the occurrence of inbreeding and crossbreeding among related individuals. The standard genetic differentiation (Gst) between adults and juveniles was significant and high (0.260), which also reinforces the divergence between generations. The analysis of spatial genetic structure for adult individuals was significant up to 750 m, that is, the distribution of adults is not random and reflects the dispersion of seeds close to the mother plant. The analysis of the reproductive system indicated alogamy with high cross - fertilization rate (tm = 0.995), and the occurrence of crosses between parenting individuals (tm - ts = 0.058). It was also observed the occurrence of gene flow between 42 and 4.749 meters. The study indicates loss of diversity, inbreeding, high genetic differentiation between generations and spatial structuring of adults. Thus, conservation strategies are extremely important to avoid extinction of the species. Dissertação (Mestrado em Ciência Florestal: Manejo Florestal) - Programa de Pós-graduação em Ciência Florestal, Universidade Federal do Acre, Rio Branco. Orientador: Marcus Vinicio Neves d'Oliveira. Coorientadora: Tatiana de Campos. 2019-07-02T00:41:25Z 2019-07-02T00:41:25Z 2019-07-01 2018 2019-11-05T11:11:11Z Teses 2018. http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110195 pt_BR pt_BR openAccess 66 f.