Estudo dos segmentos de homozigose em uma população de suínos.

Resumo: Marcadores do tipo SNP (Polimorfismo de nucleotídeo único) são úteis em estudos de estrutura da população e conservação genética, permitindo obter informações sobre a história de uma população e parentesco entre seus indivíduos. Para investigar o histórico de seleção de uma linhagem comercial materna de suínos, 300 fêmeas e 25 machos foram analisados utilizando um painel de SNPs de 60K para a detecção de segmentos de homozigose (ROH, do inglês Runs of Homozygosity) com alta frequência populacional. As regiões de ROH em mais de 30% dos animais foram investigadas para identificar possíveis regiões conservadas. Um grande número de ROHs longos (> 5Mb) foi encontrado podendo indicar recentes eventos de endogamia na população estudada. Nas regiões de homozigose com frequência maior que 30% foram identificados 240 genes, dos quais alguns estão descritos como envolvidos na expressão de características reprodutivas e de comportamento. Logo, o presente estudo reforça a eficácia na utilização de dados de ROH para o estudo do histórico de seleção em populações animais, e sugere que os ancestrais da população estudada possivelmente foram submetidos a seleção direta ou indireta para características reprodutivas e comportamentais. Abstract: Single nucleotide polymorphism (SNP) markers are useful to study population structure and conservation genetics, which allows assessing information about population history and the relationship among individuals. To investigate the population history, 300 females and 25 males from a commercial maternal pig line were analyzed using genomic data to detect runs of homozygosity (ROH). The ROH regions present in more than 30% of the samples were investigated to identify possible conserved regions. A large number of long ROHs (> 5Mb) were found and might indicate recent inbreeding events in the studied population. In the homozygous regions with frequency greater than 30% 240 genes were identified, which some of them were described affecting behavioral and reproductive traits. Therefore, the study showed evidence that the ancestors of the studied population have undergone direct or indirect selectionfor behavior and reproduction traits.

Bibliographic Details

Main Authors:	JOAQUIM, L. B., NASCIMENTO, G. B. do, MARCHESI, J. A. P., SAVEGNAGO, R. P., CANTAO, M. E., LEDUR, M. C., MUNARI, D. P.
Other Authors:	LETÍCIA BORGES JOAQUIM, UNESP/Jaboticabal; GUILHERME BATISTA DO NASCIMENTO, UNESP/Jaboticabal; JORGE AUGUSTO PETROLI MARCHESI, USP; RODRIGO PELICIONI SAVEGNAGO, UNESP/Jaboticabal; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; DANÍSIO PRADO MUNARI, UNESP/Jaboticabal.
Format:	Separatas biblioteca
Language:	pt_BR por
Published:	2017-10-19
Subjects:	Reprodução animal, Melhoramento genético animal, Suíno, Polimorfismo, Linhagem,
Online Access:	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077688
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