Avaliação funcional do promotor do gene AnatrC de Aspergillus nidulans na planta modelo Setaria viridis.
A cana-de-açúcar tem um papel fundamental na economia do Brasil, pois contribui para o setor açucareiro e biocombustível. O bagaço da cana é uma rica fonte para a produção de bioetanol, um processo ainda inviável, em nível comercial, pelo custo benefício. Mas, com o desenvolvimento de alternativas viáveis para a degradação da parede celular da cana-de-açúcar sem a necessidade de altas temperaturas e ácidos fortes, poderia viabilizar economicamente a produção deste biocombustível, sem a necessidade de aumento da área de plantio. Uma das alternativas em estudo é a engenharia genética de plantas com a degradação controlada da parede celular, ao final do ciclo de produção. Desta forma, a identificação de promotores com indução regulada em plantas é extremamente desejável para serem utilizados na geração de plantas transgênicas com expressão controlada. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do promotor do gene atrC, isolado do fungo Aspergillus nidulans, em controlar a expressão do gene uidA (GUS), na planta modelo Setaria viridis. Esse promotor foi escolhido devido à indução em presença de baixas concentrações de etanol, identificada em estudos anteriores (ANDRADE, 2000). Uma análise in silico inicial da sequência do promotor atrC foi realizada utilizando o programa PlantCare, com o objetivo de se identificar elementos cis, elementos esses presentes em promotores regulados, resultando na identificação de vários elementos na sequência do promotor. Posteriormente, foram realizados ensaios de transformação genética com a construção contendo o promotor patrC:uidA na planta modelo S. viridis via Agrobacterium tumefaciens. Após comprovação das plantas transformadas, ensaios foram montados para testes histoquímicos, e verificando-se atividade endógena de GUS em S. viridis. Análises para otimização dos ensaios histoquímicos foram realizados, constatando-se uma alta atividade endógena em soluções de pH mais ácido. Estabelecidas as condições ideais, foram realizados testes histoquímicos com a finalidade de verificar a eficiência do promotor em controlar a expressão do gene uidA, na presença de diferentes compostos químicos. Os resultados confirmaram a indução do promotor atrC em raízes, por etanol e ciclo-hexamida. Essa indução por etanol também foi confirmada em experimentos de qPCR.
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2017-03-16
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Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1067200 |
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dig-alice-doc-10672002017-03-17T01:56:07Z Avaliação funcional do promotor do gene AnatrC de Aspergillus nidulans na planta modelo Setaria viridis. VASCONCELOS, V. D. B. VANESSA DINIZ BARCELOS VASCONCELOS. Promotor atrC Cana-de-açúcar Setaria viridis Sugarcane A cana-de-açúcar tem um papel fundamental na economia do Brasil, pois contribui para o setor açucareiro e biocombustível. O bagaço da cana é uma rica fonte para a produção de bioetanol, um processo ainda inviável, em nível comercial, pelo custo benefício. Mas, com o desenvolvimento de alternativas viáveis para a degradação da parede celular da cana-de-açúcar sem a necessidade de altas temperaturas e ácidos fortes, poderia viabilizar economicamente a produção deste biocombustível, sem a necessidade de aumento da área de plantio. Uma das alternativas em estudo é a engenharia genética de plantas com a degradação controlada da parede celular, ao final do ciclo de produção. Desta forma, a identificação de promotores com indução regulada em plantas é extremamente desejável para serem utilizados na geração de plantas transgênicas com expressão controlada. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do promotor do gene atrC, isolado do fungo Aspergillus nidulans, em controlar a expressão do gene uidA (GUS), na planta modelo Setaria viridis. Esse promotor foi escolhido devido à indução em presença de baixas concentrações de etanol, identificada em estudos anteriores (ANDRADE, 2000). Uma análise in silico inicial da sequência do promotor atrC foi realizada utilizando o programa PlantCare, com o objetivo de se identificar elementos cis, elementos esses presentes em promotores regulados, resultando na identificação de vários elementos na sequência do promotor. Posteriormente, foram realizados ensaios de transformação genética com a construção contendo o promotor patrC:uidA na planta modelo S. viridis via Agrobacterium tumefaciens. Após comprovação das plantas transformadas, ensaios foram montados para testes histoquímicos, e verificando-se atividade endógena de GUS em S. viridis. Análises para otimização dos ensaios histoquímicos foram realizados, constatando-se uma alta atividade endógena em soluções de pH mais ácido. Estabelecidas as condições ideais, foram realizados testes histoquímicos com a finalidade de verificar a eficiência do promotor em controlar a expressão do gene uidA, na presença de diferentes compostos químicos. Os resultados confirmaram a indução do promotor atrC em raízes, por etanol e ciclo-hexamida. Essa indução por etanol também foi confirmada em experimentos de qPCR. Dissertação (mestrado em Biotecnologia Vegetal) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, MG. Orientador: Alan Carvalho Andrade, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Coorientador: Hugo Bruno Correa Molinari. 2017-03-16T23:50:28Z 2017-03-16T23:50:28Z 2017-03-16 2014 2017-03-16T23:50:28Z Teses 2014. http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1067200 pt_BR por openAccess il. 66 p. |
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A cana-de-açúcar tem um papel fundamental na economia do Brasil, pois contribui para o setor açucareiro e biocombustível. O bagaço da cana é uma rica fonte para a produção de bioetanol, um processo ainda inviável, em nível comercial, pelo custo benefício. Mas, com o desenvolvimento de alternativas viáveis para a degradação da parede celular da cana-de-açúcar sem a necessidade de altas temperaturas e ácidos fortes, poderia viabilizar economicamente a produção deste biocombustível, sem a necessidade de aumento da área de plantio. Uma das alternativas em estudo é a engenharia genética de plantas com a degradação controlada da parede celular, ao final do ciclo de produção. Desta forma, a identificação de promotores com indução regulada em plantas é extremamente desejável para serem utilizados na geração de plantas transgênicas com expressão controlada. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do promotor do gene atrC, isolado do fungo Aspergillus nidulans, em controlar a expressão do gene uidA (GUS), na planta modelo Setaria viridis. Esse promotor foi escolhido devido à indução em presença de baixas concentrações de etanol, identificada em estudos anteriores (ANDRADE, 2000). Uma análise in silico inicial da sequência do promotor atrC foi realizada utilizando o programa PlantCare, com o objetivo de se identificar elementos cis, elementos esses presentes em promotores regulados, resultando na identificação de vários elementos na sequência do promotor. Posteriormente, foram realizados ensaios de transformação genética com a construção contendo o promotor patrC:uidA na planta modelo S. viridis via Agrobacterium tumefaciens. Após comprovação das plantas transformadas, ensaios foram montados para testes histoquímicos, e verificando-se atividade endógena de GUS em S. viridis. Análises para otimização dos ensaios histoquímicos foram realizados, constatando-se uma alta atividade endógena em soluções de pH mais ácido. Estabelecidas as condições ideais, foram realizados testes histoquímicos com a finalidade de verificar a eficiência do promotor em controlar a expressão do gene uidA, na presença de diferentes compostos químicos. Os resultados confirmaram a indução do promotor atrC em raízes, por etanol e ciclo-hexamida. Essa indução por etanol também foi confirmada em experimentos de qPCR. |
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