Sistemática fundamentos, métodos, aplicaciones
Bibliografía: páginas 411-505
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Distrito Federal, México Universidad Nacional Autónoma de México. Facultad de Ciencias. Ciudad Universitaria
2013
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KOHA-OAI-ECOSUR:631252023-05-26T22:34:00ZSistemática fundamentos, métodos, aplicaciones Morrone Lupi, Juan José autor textDistrito Federal, México Universidad Nacional Autónoma de México. Facultad de Ciencias. Ciudad Universitaria2013spaBibliografía: páginas 411-505Capítulo 1 ¬ Introducción.. Relevancia general de la sistemática.. Términos sistemáticos básicos.. Sistemática y taxonomía.. Clasificación e identificación.. Nomenclatura.. Jerarquías.. Taxón y categoría.. Relaciones sistemáticas.. Relaciones cladísticas.. Relaciones fenéticas.. Relaciones cronísticas.. Relaciones geográficas.. Dendrogramas.. Filogramas.. Cladogramas.. Fenogramas.. Cronogramas.. Razonamiento filogenético.. Epistemología de la sistemática.. Lecturas recomendadas.. Capítulo 2 ¬ Historia de la sistemática.. Sistemática prelinneana.. Filósofos y naturalistas griegos.. Bestiarios y herbarios medievales.. La sistemática en el Renacimiento.. Sistemática clásica.. Carl Linneo.. Comte de Buffon.. Arquetipos y homología.. La sistemática en Francia.. Arreglos y mapas de afinidades.. Sistemática darwiniana.. Charles Darwin.. Darwinianos germanohablantes.. Darwinianos británicos.. Hologénesis.. Darwinianos americanos.. La nueva sistemática.. La sistemática en el siglo XX.. Sistemática filogenética.. Sistemática evolutiva.. Feneticismo.. Sistemática práctica.. Cladística numérica.. Cladismo de patrón.. Sistemática molecular.. La sistemática actual.. Lecturas recomendadas.. Capítulo 3 ¬ Caracteres sistemáticos.. Homología.. Pruebas de homología filogenética.. Homología molecular.. Caracteres y estados de carácter.. Atributos inadmisibles como caracteres.. Tipos de caracteres.. Caracteres morfológicos.. Caracteres fisiológicos y químicos.. Caracteres moleculares.. Caracteres etológicos.. Caracteres ecológicos.. Caracteres biogeográficos.. Caracteres estratigráficos.. ¿Cuáles son los mejores caracteres?.. Lecturas recomendadas.. Capítulo 4 ¬ Análisis filogenético.. Conceptos básicos.. Sinapomorfía, simplesiomorfía y homoplasia.. Monofilia, parafilia y polifilia.. Selección de taxones.. Taxones supraespecíficos.. Especies.. Especímenes.. Análisis de caracteres.. Comparación con el grupo externo (outgroup).. Otros criterios.. Codificación de caracteres.. Caracteres binarios.. Caracteres multiestado.. Caracteres morfométricos.. Matrices de datos.. Estados faltantes e inaplicables.. Estados polimórficos.. Alineación de secuencias de ADN.. Métodos basados en el principio de parsimonia.. Argumentación hennigiana.. Árbol de Wagner.. Búsqueda exhaustiva.. Búsqueda branch and bound.. Búsqueda por permutación de ramas (branch swapping).. Parsimonia de matraca.. Criterios de optimalidad.. Optimalidad de Wagner.. Optimalidad de Fitch.. Optimización de Dollo.. Optimalidad de Camin-Sokal.. Optimalidad de polimorfismos.. Optimalidad generalizada.. ACCTRAN y DELTRAN.. Optimización de valores faltantes.. Pesado de caracteres.. Pesado de caracteres a priori.. Compatibilidad.. Pesado de caracteres sucesivo.. Pesado de caracteres implícito.. Pesado de caracteres moleculares.. Métodos probabilísticos.. Verosimilitud máxima.. Inferencia bayesiana.. Otros enfoques filogenéticos.. Compatibilidad de caracteres.. Enunciados de tres taxones.. Métodos de distancia.. Comparación de los métodos.. Soporte de los cladogramas.. Longitud.. Índice de consistencia.. Índice de retención.. Índice de consistencia rescalado.. Índice de exceso de homoplasia.. Evaluación del soporte de grupos.. Bootstrapping.. Jackknifing.. Soporte de Bremer.. Pruebas de aleatorización.. Distribución de las longitudes de los cladogramas (DCL).. Remoción de caracteres.. Remuestreo simétrico.. Cladogramas múltiples.. Cladogramas de consenso.. Subcladograma podado común (common prunned subcladogram).. Pesos sucesivos..Decisividad de los datos.. Evidencia total y análisis particionado.. Análisis de evidencia total.. Análisis particionado o congruencia taxonómica.. Análisis combinado condicional.. Superárboles.. Programas de cómputo.. Formatos de archivos.. FASTA.. Hennig86.. MEGA.. NEXUS.. PHYLIP.. Lecturas recomendadas.. Capítulo 5 ¬ Especies: conceptos, reconocimiento y descripción.. Desarrollo histórico de los conceptos de especie.. Concepto folk.. Concepto tipológico.. Concepto morfológico.. Concepto biológico.. Concepto evolutivo.. Concepto filogenético.. ¿Cuál es el mejor concepto?.. ¿Cuántas especies de seres vivos existen?.. Modelos de especiación.. Modelo de especiación alopátrida.. Modelo de especiación peripátrida.. Modelo de especiación aloparapátrida.. Modelo de especiación parapátrida.. Modelo de especiación simpátrida.. Mecanismos de aislamiento reproductivo.. Mecanismos precopulatorios.. Mecanismos poscopulatorios.. Variación intraespecífica.. Variedad.. Raza geográfica.. Subespecie.. Semiespecie.. Clon.. Clina.. Círculo de razas.. Variación intrapoblacional.. Lecturas recomendadas.. Capítulo 6 ¬ Actividades sistemáticas básicas.. Reconocimiento de especies.. Análisis de la variación intraespecífica.. Selección de caracteres cuantitativos.. Análisis univariado.. Análisis bivariado y trivariado.. Análisis multivariado.. Morfometría geométrica.. Descripción de especies.. Diagnosis.. Descripción.. Notas comparativas.. Ecología.. Distribución.. Etimología.. Tipos y otros materiales examinados.. Publicación.. Clasificación.. Clasificación filogenética.. Categorías linneanas supraespecíficas.. Subordinación y secuenciación.. Convenciones para clasificaciones linneanas.. Clasificación de taxones fósiles.. Metataxones.. Alternativas a las clasificaciones filogenéticas linneanas.. Bases de datos sistemáticos.. E-sistemática.. Identificación.. Experiencia básica.. Colecciones sistemáticas.. Claves.. Claves de acceso único.. Claves de acceso múltiple.. ¿Cómo construir una clave?.. Obtención de ayuda de un especialista.. Código de barras de ADN.. Floras y faunas.. Revisiones sistemáticas.. Actividades preliminares.. Identificación de grupos de especímenes y análisis de caracteres.. Análisis sistemático.. Preparación del manuscrito.. Otras publicaciones sistemáticas.. Programas de cómputo.. Lecturas recomendadas.. Capítulo 7 ¬ Nomenclatura.. Objetivo de la nomenclatura biológica.. Códigos de nomenclatura.. Breve historia.. Estructura y regulaciones.. Principios generales.. Independencia.. Nomenclatura binominal.. Prioridad.. Homonimia.. Sinonimia.. Coordinación.. Primer revisor.. Tipificación.. Lenguaje.. Retroactividad.. Nombres científicos.. Número de palabras en los nombres.. Estatus de los nombres.. Publicación.. Disponibilidad o validez de publicación.. Validez o legitimidad.. Corrección.. Autoría y fecha de publicación.. Formación y tratamiento de los nombres.. Nombres genéricos.. Nombres específicos.. Nombres de taxones híbridos.. Enmiendas de nombres.. Grafías originales múltiples.. Indicación de la edad geológica.. Indicación de la distribución biogeográfica.. Tipificación.. Géneros tipo.. Especies tipo.. Especímenes tipo.. Localidad tipo.. Nomenclatura abierta.. Nomenclatura filogenética.. Nombres supraespecíficos.. Nombres de especies.. Críticas a la nomenclatura filogenética.. Nomenclatura filogenética alternativa.. Desafíos.. Publicación y registro.. Prioridad.. Tipos.. Biocódigo.. Lecturas recomendadas.. Capítulo 8. Más allá de la sistemática.. Morfología filogenética.. Adaptación..Prueba de hipótesis adaptativas.. Diversificación adaptativa.. Convergencia adaptativa.. Método comparativo.. Coevolución.. Coespeciación.. Análisis de parsimonia de Brooks.. Análisis de árboles reconciliados.. Coadaptación.. Biogeografía evolutiva.. Identificación de componentes bióticos.. Relaciones entre componentes bióticos.. Análisis de subárboles libres de paralogía.. Identificación de cenocrones.. Filogeografía.. Hipótesis filogeográficas.. Filogeografía comparada.. Estudio de caso.. Datación de linajes.. Hibridación.. Constreñimientos del desarrollo.. Ecología de comunidades.. Paleontología.. Grupos tronco y corona.. Ajuste estratigráfico.. Paralogía temporal.. Estudio de caso.. Conservación de la biodiversidad.. Establecimiento de prioridades para la conservación.. Índices de peso filogenético.. Índices de divergencia filogenética.. Dispersión filogenética.. Complementariedad.. Estudio de caso.. Lingüística histórica.. Epidemiología molecular.. Programas de cómputo.. Lecturas recomendadas.. ReferenciasTaxonomíaEvolución (Biología)Filogenia |