Diferenciación intrapoblacional del ratón chiapaneco Peromyscus zarhynchus (Rodentia: cricetidae)

Diferenciación intrapoblacional del ratón chiapaneco Peromyscus zarhynchus (Rodentia: cricetidae)

El ratón chiapaneco, Peromyscus zarhynchus es una especie endémica y monotípica, con protección especial bajo la Norma Oficial Mexicana NOM-059-ECOL-2010. En este estudio se estimó y analizo la diversidad y estructura genética, y variación morfológica de cinco poblaciones localizadas en el Cerro Tzontehuitz, Reserva Ecológica Huitepec, Oxchuc, Coapilla y el Parque Nacional Lagos de Montebello utilizando cuatro marcadores moleculares microsatélites así como un análisis de la coloración del pelaje. Los datos moleculares mostraron que existe una alta diversidad genética en la especie, al igual que a nivel poblacional (95% de loci polimórficos y un promedio de 2.75 alelos por locus). Los valores promedio de heterocigosídad observada (0.757) y esperada (0.520) fueron altos y el coeficiente de endogamia (F) estimado indica un exceso de heterocigotos, por lo que se encuentran lejos de tener problemas de consanguinidad. La estructura de la diversidad genética de P. zarhynchus demostró que existe una moderada diferenciación genética entre las poblaciones (FST =0.068), esta diferenciación también se vio reflejada en los resultados del análisis de varianza molecular (AMOVA; FST=0.105), explicando que la mayor parte de la variación se encuentra dentro de las poblaciones en un 89% y solo un 11% explica la variación entre poblaciones.

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Main Authors: Rojas Gutiérrez, Andrea Guadalupe autor/a, Espinoza Medinilla, Eduardo E. Doctor director 13969, Lorenzo Monterrubio, Consuelo Doctora asesora 7187, García Bautista, Maricela asesora 8676
Format: Texto biblioteca
Language:spa
Published: Tuxtla Gutiérrez, Chiapas, México Universidad de Ciencias y Artes de Chiapas, Facultad de Ciencias Biológicas 2011
Subjects:Peromyscus zarhynchus, Población animal, Estructuras genéticas, Variación morfológica, Frosur,
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Diferenciación intrapoblacional del ratón chiapaneco Peromyscus zarhynchus (Rodentia: cricetidae)
description El ratón chiapaneco, Peromyscus zarhynchus es una especie endémica y monotípica, con protección especial bajo la Norma Oficial Mexicana NOM-059-ECOL-2010. En este estudio se estimó y analizo la diversidad y estructura genética, y variación morfológica de cinco poblaciones localizadas en el Cerro Tzontehuitz, Reserva Ecológica Huitepec, Oxchuc, Coapilla y el Parque Nacional Lagos de Montebello utilizando cuatro marcadores moleculares microsatélites así como un análisis de la coloración del pelaje. Los datos moleculares mostraron que existe una alta diversidad genética en la especie, al igual que a nivel poblacional (95% de loci polimórficos y un promedio de 2.75 alelos por locus). Los valores promedio de heterocigosídad observada (0.757) y esperada (0.520) fueron altos y el coeficiente de endogamia (F) estimado indica un exceso de heterocigotos, por lo que se encuentran lejos de tener problemas de consanguinidad. La estructura de la diversidad genética de P. zarhynchus demostró que existe una moderada diferenciación genética entre las poblaciones (FST =0.068), esta diferenciación también se vio reflejada en los resultados del análisis de varianza molecular (AMOVA; FST=0.105), explicando que la mayor parte de la variación se encuentra dentro de las poblaciones en un 89% y solo un 11% explica la variación entre poblaciones.
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Los datos moleculares mostraron que existe una alta diversidad genética en la especie, al igual que a nivel poblacional (95% de loci polimórficos y un promedio de 2.75 alelos por locus). Los valores promedio de heterocigosídad observada (0.757) y esperada (0.520) fueron altos y el coeficiente de endogamia (F) estimado indica un exceso de heterocigotos, por lo que se encuentran lejos de tener problemas de consanguinidad. La estructura de la diversidad genética de P. zarhynchus demostró que existe una moderada diferenciación genética entre las poblaciones (FST =0.068), esta diferenciación también se vio reflejada en los resultados del análisis de varianza molecular (AMOVA; FST=0.105), explicando que la mayor parte de la variación se encuentra dentro de las poblaciones en un 89% y solo un 11% explica la variación entre poblaciones.El flujo genético (Nm) estimado para todas las poblaciones fue de 3.426. Entre pares poblacionales la población de Coapilla y Lagos de Montebello son las menos relacionadas genéticamente; por el contrario, las poblaciones más relacionadas genéticamente fueron Oxchuc y Lagos de Montebello. No se encontró una correlación significativa (P>0.05) entre las distancias genéticas y distancias geográficas ni tampoco entre el FST y distancias geográficas, lo que sugiere que existe un aislamiento por distancia relativamente bajo actuando sobre las poblaciones de P. zarhynchus. En el dendrograma obtenido a partir de las distancias genéticas de Nei (1972) se obtuvieron dos grupos: en el primero las poblaciones que se encuentran más relacionadas genéticamente son Oxchuc y la Reserva Ecológica Huitepec con una relación cercana la población de Lagos de Montebello; en el segundo se encuentran relacionadas las poblaciones de Coapilla y Cerro Tzontehuitz. En el análisis de variación morfológica del color del pelaje los resultados de ANOVA revelaron que existen variación significativa (P<0.001) en las poblaciones y a través del análisis de Duncan se encontraron diferencias significativas (P<0.05) entre pares poblacionales siendo notoria la diferencia en la coloración del pelaje que presentan los individuos de la población de Coapilla con respecto a las otras poblaciones.Tesis Incluye bibliografíaRESUMEN.. 1. INTRODUCCIÓN.. 2. ANTECEDENTES.. 2.1. Estudios taxonómicos y ecológicos.. 2.2. Estudios genéticos.. 3. OBJETIVOS.. 3.1. General.. 3.2. Específicos.. 4. HIPÓTESIS.. 5. MATERIAL Y MÉTODOS.. 5.1. Área de estudio.. 5.2. Análisis genético.. 5.2.1. Obtención de muestras.. 5.2.2. Extracción y visualización de ADN.. 5.2.3. Amplificación del ADN.. 5.2.4. Análisis de geles de acrilamida.. 5.2.5. Análisis estadísticos.. 5.3. Análisis de coloración.. 5.3.1. Obtención demuestras.. 5.3-2. Registro de coloración.. 5.3.3. Análisis estadísticos.. 5.4.4. Clave Munsell.. 6. RESULTADOS.. 6.1. Análisis genético.. 6.1.1. Amplificación del ADN.. 6.1.2. Frecuencias alélicas y polimorfismo.. 6.1.3. Heterocigosidad y equilibrio de Hardy-Weinberg.. 6.1.4. Coeficiente de endogamia.. 6. i .5. Diferenciación genética y flujo genético.. 6.1.6. Distancias genéticas de Nei: páginas 972.. 6.1.7. Prueba Mantel.. 6.2. Análisis de coloración.. 6.2.1. Análisis estadísticos.. 6.2.2. Clave Munsell.. 7. DISCUSIÓN.. 8. CONCLUSIÓN.. 9. LITERATURA CITADA.. 10. APÉNDICESApéndice 1. Lista de individuos por población de Peromyscus zarhynchus analizados mediante microsatélites. JBC=J. Bolaños C.; CLM=C. Lorenzo M.; MGB=M. García B.. Apéndice 2. Protocolo de extracción de ADN por el método de lisis celular/fenol-cloroformo- alcohol isoamílico.. Apéndice 3. Electroforesis en gel de agarosa al 1% para visualización de ADN.. Apéndice 4. Electroforesis en geles de acrilamida al 10%.. Apéndice 5. Lista de individuos por población de Peromyscus zarhynchus con la relación de los registros de color Tristimulus CIE X, Y, Z obtenidos mediante el espectrofotómetro para cada región del cuerpo y el brillo que es el resultado de la suma de estas variables.. Apéndice 6. Resultados obtenidos de las muestras de ADN amplificadas para cada uno de los loci microsatélites en las 46 muestras de las cinco poblaciones de Peromyscus zarhynchusEl ratón chiapaneco, Peromyscus zarhynchus es una especie endémica y monotípica, con protección especial bajo la Norma Oficial Mexicana NOM-059-ECOL-2010. En este estudio se estimó y analizo la diversidad y estructura genética, y variación morfológica de cinco poblaciones localizadas en el Cerro Tzontehuitz, Reserva Ecológica Huitepec, Oxchuc, Coapilla y el Parque Nacional Lagos de Montebello utilizando cuatro marcadores moleculares microsatélites así como un análisis de la coloración del pelaje. Los datos moleculares mostraron que existe una alta diversidad genética en la especie, al igual que a nivel poblacional (95% de loci polimórficos y un promedio de 2.75 alelos por locus). Los valores promedio de heterocigosídad observada (0.757) y esperada (0.520) fueron altos y el coeficiente de endogamia (F) estimado indica un exceso de heterocigotos, por lo que se encuentran lejos de tener problemas de consanguinidad. La estructura de la diversidad genética de P. zarhynchus demostró que existe una moderada diferenciación genética entre las poblaciones (FST =0.068), esta diferenciación también se vio reflejada en los resultados del análisis de varianza molecular (AMOVA; FST=0.105), explicando que la mayor parte de la variación se encuentra dentro de las poblaciones en un 89% y solo un 11% explica la variación entre poblaciones.El flujo genético (Nm) estimado para todas las poblaciones fue de 3.426. Entre pares poblacionales la población de Coapilla y Lagos de Montebello son las menos relacionadas genéticamente; por el contrario, las poblaciones más relacionadas genéticamente fueron Oxchuc y Lagos de Montebello. No se encontró una correlación significativa (P>0.05) entre las distancias genéticas y distancias geográficas ni tampoco entre el FST y distancias geográficas, lo que sugiere que existe un aislamiento por distancia relativamente bajo actuando sobre las poblaciones de P. zarhynchus. En el dendrograma obtenido a partir de las distancias genéticas de Nei (1972) se obtuvieron dos grupos: en el primero las poblaciones que se encuentran más relacionadas genéticamente son Oxchuc y la Reserva Ecológica Huitepec con una relación cercana la población de Lagos de Montebello; en el segundo se encuentran relacionadas las poblaciones de Coapilla y Cerro Tzontehuitz. En el análisis de variación morfológica del color del pelaje los resultados de ANOVA revelaron que existen variación significativa (P<0.001) en las poblaciones y a través del análisis de Duncan se encontraron diferencias significativas (P<0.05) entre pares poblacionales siendo notoria la diferencia en la coloración del pelaje que presentan los individuos de la población de Coapilla con respecto a las otras poblaciones.Peromyscus zarhynchusPoblación animalEstructuras genéticasVariación morfológicaFrosur

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