Diversité génétique et variabilité du pouvoir pathogène de Xanthomonas albineans, agent causal de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre
La diversité génétique de 162 souches de #Xanthomonas albilineans# originaires de 32 régions productrices de canne à sucre a été analysée par AFLP après adaptation de la technique à cette espèce bactérienne. Cinquante neuf haplotypes différents ont été mis en évidence et 8 groupes génétiques différents ont été définis à partir d'une analyse hiérarchique ascendante. Certains groupes AFLP contiennent des souches d'origines géographiques diverses tandis que d'autres rassemblent des souches d'une seule zone de culture (Afrique tropicale, Papouasie-Nouvelle-Guinée). La technique AFLP permet d'étudier la structure des populations de #X. albilineans# de façon complémentaire à la technique RFLP utilisée par ailleurs. Vu que le polymorphisme détecté par AFLP est inférieur, les relations génétiques entre groupes RFLP peuvent être estimées. En utilisant la technique AFLP appliquée à #X. albilineans#, il a aussi été possible de différencier les autres espèces de #Xanthomonas# pathogènes de la canne à sucre. Le pouvoir pathogène de 7 souches de #X. albilineans# originaires de Guadeloupe a été évalué par inoculation en serre de trois cultivars de canne à sucre. Les feuilles inoculées avec l'agent pathogène ont présenté des symptômes deux à quatre semaines après l'innoculation. Néanmoins, les souches n'ont pas pu être différenciées en se basant sur leur pathogénie à cause du faible développement de la maladie sur les feuilles nouvellement formées. Une comparaison entre la variabilité du pouvoir pathogène de diverses souche de #X. albilineans#, analysée au cours d'études antérieures, et la diversité génétique par AFLP, n'a pas permis de mettre en évidence une relation simple entre ces deux caractéristiques de l'agent pathogène.
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La diversité génétique de 162 souches de #Xanthomonas albilineans# originaires de 32 régions productrices de canne à sucre a été analysée par AFLP après adaptation de la technique à cette espèce bactérienne. Cinquante neuf haplotypes différents ont été mis en évidence et 8 groupes génétiques différents ont été définis à partir d'une analyse hiérarchique ascendante. Certains groupes AFLP contiennent des souches d'origines géographiques diverses tandis que d'autres rassemblent des souches d'une seule zone de culture (Afrique tropicale, Papouasie-Nouvelle-Guinée). La technique AFLP permet d'étudier la structure des populations de #X. albilineans# de façon complémentaire à la technique RFLP utilisée par ailleurs. Vu que le polymorphisme détecté par AFLP est inférieur, les relations génétiques entre groupes RFLP peuvent être estimées. En utilisant la technique AFLP appliquée à #X. albilineans#, il a aussi été possible de différencier les autres espèces de #Xanthomonas# pathogènes de la canne à sucre. Le pouvoir pathogène de 7 souches de #X. albilineans# originaires de Guadeloupe a été évalué par inoculation en serre de trois cultivars de canne à sucre. Les feuilles inoculées avec l'agent pathogène ont présenté des symptômes deux à quatre semaines après l'innoculation. Néanmoins, les souches n'ont pas pu être différenciées en se basant sur leur pathogénie à cause du faible développement de la maladie sur les feuilles nouvellement formées. Une comparaison entre la variabilité du pouvoir pathogène de diverses souche de #X. albilineans#, analysée au cours d'études antérieures, et la diversité génétique par AFLP, n'a pas permis de mettre en évidence une relation simple entre ces deux caractéristiques de l'agent pathogène. |
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