Análisis de secuencias de genes de Coffea arabica var. Caturra

En la presente investigación se desarrollaron genotecas de ADNc de tres tejidos (hoja, flor y fruto) de var. Caturra, con el fin de obtener información sobre los genes que se están expresando en estos tejidos. De 3.029 secuencias analizadas, se obtuvo un total de 1.824 transcritos únicos (unigenes), para las tres genotecas, y el 60 por ciento de estos transcritos mostraron similaridad con secuencias reportadas para C canephora. Los análisis de los clones indentificados mostraron una amplia diversidad de genes involucrados en diversas funciones metabólicas. Las principales categorías incluyen proteínas involucradas en organización celular y biogénesis, metabolismo, síntesis de proteínas, transporte, trancripción, transducción de señales y respuesta a patógenos o plagas. Los transcritos involucrados en respuesta a patógenos, plagas y estrés abiótico, podrían ser usados en experimentos de laboratorio para confirmar su función y determinar su potencial de uso en programas de mejoramiento genético del café.

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Bibliographic Details
Main Authors: 95721 Montoya Ortíz, G.E., 59884 Cristancho Ardila, M.A., 95127 Moncada Botero, M.P.
Format: biblioteca
Published: (Abr
Subjects:COFFEA ARABICA, COFFEA CANEPHORA, GENETICA MOLECULAR, GENES, GENETICA, RESERVA GENETICAS, HOJAS, FLORES, FRUTO, SECUENCIA NUCLEOTIDICA, CLONES, METABOLISMO,
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Description
Summary:En la presente investigación se desarrollaron genotecas de ADNc de tres tejidos (hoja, flor y fruto) de var. Caturra, con el fin de obtener información sobre los genes que se están expresando en estos tejidos. De 3.029 secuencias analizadas, se obtuvo un total de 1.824 transcritos únicos (unigenes), para las tres genotecas, y el 60 por ciento de estos transcritos mostraron similaridad con secuencias reportadas para C canephora. Los análisis de los clones indentificados mostraron una amplia diversidad de genes involucrados en diversas funciones metabólicas. Las principales categorías incluyen proteínas involucradas en organización celular y biogénesis, metabolismo, síntesis de proteínas, transporte, trancripción, transducción de señales y respuesta a patógenos o plagas. Los transcritos involucrados en respuesta a patógenos, plagas y estrés abiótico, podrían ser usados en experimentos de laboratorio para confirmar su función y determinar su potencial de uso en programas de mejoramiento genético del café.