Desenvolvimento e validação de uma plataforma de genotipagem em larga escala para Coffea canephora
O cultivo de espécies de café como Coffea canephora e C. arabica, são muito importantes em regiões tropicais de todo o mundo e possuem grande valor econômico e cultural. As plataformas de genotipagem de SNPs oferecem ensaios altamente multiplexados a um custo relativamente baixo e podem ser uma ferramenta válida para a identificação dos marcadores associados a características de interesse. Neste trabalho é proposto o desenvolvimento e a validação de uma plataforma de genotipagem Affymetrix Axiom (®) para C. canephora (Coffee Axiom chip – 26K) com SNPs identificados a partir de dados de resequenciamento de pools de C. canephora, cobrindo a maior parte da diversidade genética conhecida para a espécie, e distribuídos ao longo de todo o genoma. Mais de 1.500 indivíduos de C. canephora foram genotipados com o chip para se avaliar a eficácia do mesmo. A grande maioria dos SNPs (20.920 ou 82%) pertence à classe de polimorfismos de alta resolução. O chip Coffee Axiom - 26K- se constitui uma ferramenta de referência para a pesquisa de genética molecular e genética de populações em espécies de café.
Main Authors: | , , , , , , , , |
---|---|
Format: | conference_item biblioteca |
Language: | por |
Published: |
EMBRAPA
|
Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/593840/ http://agritrop.cirad.fr/593840/1/412-3112-1-PB.pdf |
Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|