Le séquençage du génome de deux trypanosomatides de plantes - Phytomonas spp.- au secours d'une taxonomie dépassée
Plusieurs espèces de plantes laticifères sont parasitées au niveau des tubes laticifères, par des Trypanosomatidae. La question de leur pouvoir pathogène reste ouverte. Un nom de genre leur a été attribué arbitrairement: " Phytomonas", uniquement basée sur la nature de l'hôte. Or il a été montré que ces organismes se multipliaient dans les insectes qui les transmettaient. De plus, depuis les années 80, on sait que d'autres trypanosomatidés, jusque là considérés comme des " trypanosomatidés monoxéniques d'insectes "" (Crithidia, Herpetomonas, Leptomonas) peuvent être transmis par hétéroptères à des fruits de diverses familles, dont les solanacées (tomate). En Amérique latine et dans la Caraïbe, il existe des trypanosomatidés intraphlo èmiques spécifiquement associées à des dépérissements de palmiers (cocotier, palmier à huile, Arecaceae), de cultures horticoles (Alpinia purpurata, Zingiberaceae) et du caféier (Rubiaceae). Le genre arbitraire Phytomonas ne reflète donc pas la diversité des trypanosomatidés se multipliant dans des milieux aussi différents que le latex, la sève, la pulpe des fruits ou des graines, sur différents continents, et ne fait pas de différence entre les organismes pathogènes responsables de maladies aux graves conséquences économiques et ceux qui s'apparentent èa des symbiontes. Nous avons travaillée à la caractérisation de ces trypanosomatidés en utilisant divers marqueurs moléculaires comme le gène du Splice Leader RNA, l'ARN r 5S, les mini cercles d'ADN kinetoplastique et les ITS de l'opéron ribosomal. En tenant compte de ces résultats, en les associant aux données sérologiques et des iso enzymes et RAPD, nous pouvons conclure à l'existence de 10 "groupes" différents. Parmi ces groupes certains se démarquent très nettement. C'est le cas des trypanosomatidés intraphlo èmiques (" groupe H ""). Par leur localisation (tubes criblées du phloème), leur effet pathogène, leur endémisme en Amérique latine, leur culture in vitro, qui contrairement aux autres ne peut se réaliser qu'avec des cellules nourricières d'insectes, et les marqueurs moléculaires, ils sont uniques. Un autre groupe se distingue : " D "", comprenant des isolats du latex de l'Ancien Monde (Inde, Sénégal et France). L'étude des caryotypes moléculaires d'un isolat de chacun de ces deux groupes (EM1 d'Euphorbia pinea de France et Hart1 associée au dépérissement du cocotier en Guyane) révèle bien deux organismes différents avec respectivement 21 chromosomes et 7 chromosomes hétérologues. L'ensemble de ces résultats ainsi que d'autres données conduisent à dire qu'il serait nécessaire de réviser la taxonomie des trypanosomatidés de plantes/insectes. Pour étayer cette présomption, le génome de deux isolats, un isolat du latex (EM1) et un du phloème (Hart1), a été séquencé au Génoscope. Les premiers résultats montrant les différences entre ces deux groupes de trypanosomatidés seront présentées. Ils permettront de fournir des clés pour établir une nouvelle taxonomie, mais aussi d'identifier de possibles nouvelles méthodes de lutte. Projet ANR -08- GENM-020-001 SEQTRYPLANT.
| Main Authors: | , , , , , , , , , |
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| Format: | conference_item biblioteca |
| Language: | fre |
| Published: |
SFP
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| Subjects: | H20 - Maladies des plantes, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/565432/ http://agritrop.cirad.fr/565432/1/document_565432.pdf |
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