Développement de marqueurs moléculaires de type microsatellites pour le diagnostic et l'étude des populations Mycosphaerella, pathogènes du bananier
Trois espèces d'ascomycètes, #Mycospaerella fijiensis#, #M. musicola# et #M. eumusae# causent les maladies foliaires les plus importantes du bananier. La création et l'utilisation d'hybrides résistants pour lutter contre ces maladies nécessitent des connaissances sur leur distribution géographique ainsi que sur la structure et l'évolution des populations pathogènes. L'objectif de ce travail était de développer des marqueurs moléculaires de type microsatellites pour le diagnostic et l'étude des populations des #Mycosphaerella#, pathogènes du bananier. L'analyse de fragments d'ADN obtenus à partir d'une banque enrichie en motifs microsatellites GA et GT pour les trois espèces pathogènes, a permis de définir des couples d'amorces dans les régions bordant ces motifs. Parmi ceux-ci, des couples d'amorces spécifiques de chacune des espèces pathogènes ont été recherchés en tenant compte de l'ensemble des espèces connues isolées à partir du bananier appartenant au genre #Mycosphaerella# ou à des genres anamorphes apparentés. Nous avons également recherché des marqueurs moléculaires polymorphes pour chaque espèce pathogène à partir d'un échantillon d'isolats provenant de différentes zones géographiques. Un à deux couples d'amorces spécifiques et 12 à 13 marqueurs polymorphes ont été définis pour chaque espèce pathogène. Ainsi, les régions microsatellites peuvent être utilisées pour le développement d'un outil de diagnostic. La spécificité des amorces devra cependant être évaluée sur un plus grand nombre d'isolats pour pouvoir valider la méthode. Ces régions permettent aussi d'obtenir aisément, pour l'étude des populations pathogènes, de nombreux marqueurs moléculaires faciles d'utilisation par séquenceurs.
| Main Author: | |
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| Format: | thesis biblioteca |
| Language: | fre |
| Published: |
Université de Bordeaux II
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| Subjects: | F30 - Génétique et amélioration des plantes, H20 - Maladies des plantes, Musa, Mycosphaerella, maladie fongique, Mycosphaerella fijiensis, Mycosphaerella musicola, marqueur génétique, microsatellite, feuille, résistance aux maladies, diagnostic, contrôle de maladies, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4993, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5025, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_11042, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27259, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27262, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_36574, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4243, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2328, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2238, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2327, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/510965/ |
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