Desenvolvimento de "inter-retrotransposon amplified polymorphism" para análise de diversidade genética em germoplasma de mandioca.

A mandioca, Manihot esculenta Crantz, possui importância econômica na maioria dos países tropicais e subtropicais. A variabilidade genética da espécie não foi totalmente explorada e novas informações podem ajudar a expandir seu uso. Os marcadores moleculares baseados em retrotransposons, devido a sua abundancia no genoma, permitem uma eficiente análise de diversidade genética. O IRAP (Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism) é baseado no polimorfismo entre retrotransposons, possui uma alta reprodutibilidade, elevado nível de polimorfismo e baixo custo. O objetivo deste trabalho foi desenvolver primers para IRAP em mandioca. Oito diferentes retrotransposons do tipo LTR foram selecionados para o desenvolvimento de IRAP e os primers baseados nestes elementos foram denominados de ME_1 a ME_8. Foram analisados 21 indivíduos (12 de Anori/AM, 6 Anamã/AM e 3 da Bahia) provenientes do banco de germoplasma de mandioca da Embrapa Amazônia Ocidental. O percentual de loci polimórficos, heterozigosidade esperada (*h) e o Índice de Shannon (*I) foram calculados usando o software PopGene 1.31. Dos oito primers desenvolvidos, dois deles (ME_1 e ME_3) produziram poucas e fracas bandas. Os demais primers produziram de 21 a 61 bandas com médias de 85% de polimorfismo (65,5 - 97), 0,33 de heterozigosidade (0,24 ? 0,40) e 0,49 de índice de Shannon (0,35 ? 0,57). Dos pares de primers desenhados, ME_4 apresentou os menores valores e o ME_8 os maiores para todos os parâmetros avaliados.

Bibliographic Details

Main Authors:	SILVA, A. M. O. DA, SILVA, G. F. da, DIAS, M. C., SOUZA, A., CLEMENT, C. R., SOUSA, N. R.
Other Authors:	GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; MIGUEL COSTA DIAS, CPAA; NELCIMAR REIS SOUSA, CPAA.
Format:	Separatas biblioteca
Language:	pt_BR por
Published:	2012-10-23
Subjects:	IRAP, Retrotransposon., Manihot Esculenta, Polimorfismo.,
Online Access:	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/937573
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