Distribuição de elementos transponíveis em cromossomos de coffea arabica

Nos últimos anos o Brasil vem se destacando na pesquisa genética de cafeeiros, principalmente na área de melhoramento. Recentemente, a pesquisa em biotecnologia de cafeeiros vem ganhando espaço devido aos trabalhos em genômica, estes trabalhos juntamente com estudos citogenéticos têm contribuído muito para o entendimento da organização genômica em algumas espécies de Coffea. Neste gênero com mais de 100 espécies, as mais importantes economicamente são Coffea arabica e C. Canephora. A primeira espécie é a única e tetraplóide (2n = 44) do gênero, enquanto as demais são auto-incompatíveis e diplóides. Apesar das análises citogenéticas e moleculares indicarem que C. arabica é um anfidiplóide, ainda existe dificuldade para se confirmar os seus parentais. Isto se deve possivelmente a alta similaridade do genoma entre estas espécies de Coffea, uma possível consequência da presença de famílias repetitivas de DNA comuns a essas espécies. Porém, ainda são escassos os estudos sobre a distribuição e caracterização de famílias de DNA repetitivos em Coffea. Estes estudos limitam-se a identificar regiões heterocromáticas e localização de sítios de DNA ribossômico (DNAr) 45S e 5S. Com relação aos elementos transponíveis (TEs), foi encontrado um predomínio de retrotransposons Copia e Gypsy. Uma vez que a identificação e localização destes elementos transponíveis pode auxiliar a compreensão da organização genômica das espécies de Coffea, o objetivo deste estudo foi identificar a distribuição cromossômica em C. arabica de três elementos transponíveis. Para isso sondas de três clones contendo as sequências de elementos transponíveis, dois transposons MuDR e Tip100 (Ca_TE-009, Ca_TE-050) e um retrotransposon LTR deal (Ca_TE-079), foram hibridadas em Coffea arabica. Os resultados indicam uma distribuição co-localizada entre os transposons analisados e regiões terminais heterocromáticas, contudo o retroelemento possui uma distribuição mais dispersa. Estudos futuros serão feitos para identificar a distribuição destes elementos transponíveis nas espécies consideradas progenitoras de C. arabica.

Bibliographic Details

Main Authors:	SILVA, C. R. M. da, LOPES, F. R., CARARETO, C. M. A., VANZELA, A. L. L., DOMINGUES, D. S., PEREIRA, L. F. P.
Other Authors:	CARLOS R. M. DA SILVA, Bolsista CBP&D/Café; FABRÍCIO R. LOPES, Bolsista FAPESP; CLAUDIA M. A. CARARETO, UNESP; ANDRÉ L. L. VANZELA, UEL; DOUGLAS S. DOMINGUES, IAPAR; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC.
Format:	Anais e Proceedings de eventos biblioteca
Language:	pt_BR por
Published:	2011-10-24T11:11:11Z
Subjects:	Elementos transponíveis., Coffea Arábica, Citogenética., fish.,
Online Access:	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/904001
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