Potencial de los códigos de barras para la identificación de huevos de peces marinos
El uso de marcadores genéticos, principalmente el que codifica para la citocromo oxidasa subunidad I (COI, conocido como códigos de barras), además de usarse en la identificación taxonómica de las especies de casi todos los animales, ha sido eficaz para conectar las diferentes etapas del desarrollo con los adultos. En el caso de los huevos de peces es casi imposible identificarlos debido a los pocos caracteres que presentan para distinguirlos. Este trabajo tuvo por objetivo determinar el potencial de los códigos de barras para la determinación taxonómica de los huevos de peces marinos. Estos fueron colectados con una red tipo MOCNESS en el Caribe mexicano y Beliceño. En total 94 huevos fueron fotografiados; posteriormente se les extrajo, amplifico y secuencio el gen COI. Las secuencias obtenidas se compararon con otras secuencias de referencia de la base de datos Barcode of Life (boldsystems.org), y se construyó un árbol de identificación usando el algoritmo Kimura 2 Parameter (K2P) con el método del vecino más cercano (NJ), para establecer a que especie pertenecen.
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| Format: | Texto biblioteca |
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| Published: |
Chetumal, Quintana Roo, México Instituto Tecnológico de Chetumal
2011
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| Subjects: | Peces de arrecifes, Huevos, Códigos de barras de ADN, Ácido desoxirribonucléico, |
| Tags: |
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| id |
KOHA-OAI-ECOSUR:50782 |
|---|---|
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koha |
| institution |
ECOSUR |
| collection |
Koha |
| country |
México |
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MX |
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Bibliográfico |
| access |
En linea |
| databasecode |
cat-ecosur |
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biblioteca |
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America del Norte |
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Sistema de Información Bibliotecario de ECOSUR (SIBE) |
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Peces de arrecifes Huevos Códigos de barras de ADN Ácido desoxirribonucléico Peces de arrecifes Huevos Códigos de barras de ADN Ácido desoxirribonucléico |
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Peces de arrecifes Huevos Códigos de barras de ADN Ácido desoxirribonucléico Peces de arrecifes Huevos Códigos de barras de ADN Ácido desoxirribonucléico Leyva Cruz, Elva María Maestra autor/a 12960 Potencial de los códigos de barras para la identificación de huevos de peces marinos |
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El uso de marcadores genéticos, principalmente el que codifica para la citocromo oxidasa subunidad I (COI, conocido como códigos de barras), además de usarse en la identificación taxonómica de las especies de casi todos los animales, ha sido eficaz para conectar las diferentes etapas del desarrollo con los adultos. En el caso de los huevos de peces es casi imposible identificarlos debido a los pocos caracteres que presentan para distinguirlos. Este trabajo tuvo por objetivo determinar el potencial de los códigos de barras para la determinación taxonómica de los huevos de peces marinos. Estos fueron colectados con una red tipo MOCNESS en el Caribe mexicano y Beliceño. En total 94 huevos fueron fotografiados; posteriormente se les extrajo, amplifico y secuencio el gen COI. Las secuencias obtenidas se compararon con otras secuencias de referencia de la base de datos Barcode of Life (boldsystems.org), y se construyó un árbol de identificación usando el algoritmo Kimura 2 Parameter (K2P) con el método del vecino más cercano (NJ), para establecer a que especie pertenecen. |
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KOHA-OAI-ECOSUR:507822023-10-27T20:48:15ZPotencial de los códigos de barras para la identificación de huevos de peces marinos Leyva Cruz, Elva María Maestra autor/a 12960 textChetumal, Quintana Roo, México Instituto Tecnológico de Chetumal2011spaEl uso de marcadores genéticos, principalmente el que codifica para la citocromo oxidasa subunidad I (COI, conocido como códigos de barras), además de usarse en la identificación taxonómica de las especies de casi todos los animales, ha sido eficaz para conectar las diferentes etapas del desarrollo con los adultos. En el caso de los huevos de peces es casi imposible identificarlos debido a los pocos caracteres que presentan para distinguirlos. Este trabajo tuvo por objetivo determinar el potencial de los códigos de barras para la determinación taxonómica de los huevos de peces marinos. Estos fueron colectados con una red tipo MOCNESS en el Caribe mexicano y Beliceño. En total 94 huevos fueron fotografiados; posteriormente se les extrajo, amplifico y secuencio el gen COI. Las secuencias obtenidas se compararon con otras secuencias de referencia de la base de datos Barcode of Life (boldsystems.org), y se construyó un árbol de identificación usando el algoritmo Kimura 2 Parameter (K2P) con el método del vecino más cercano (NJ), para establecer a que especie pertenecen.De los 94 huevos, se obtuvieron 67 secuencias con más de 600 pares de bases; una con 558 y otra de 354, el resto no dio resultados positivos, así se obtuvo 73.4% de eficacia de la técnica. De las secuencias obtenidas , no se observaron inserciones, deleciones, ni seudogenes. De los 69 especímenes positivos, pudimos identificar 18 especies, 18 géneros y 16 familias. Entre las especies de importancia comercial se determinaron Xiphias gladius, Auxis thazard, katsuwonus pelamis y Lachnolaimus maximus. Tambien se encontraron especies arrecifales como Acanthurus bahianus, A. chirurgus, Halicoeres bivittatus y H. maculipinna. Además aparecieron dos especies no registradas previamente en las costas de Quintana Roo y Belice, Diplospinus multistriatus y Synagrops bellus. De las 18 especies ocho no presentaban descripciones para la etapa de huevo, por lo que en este trabajo se describieron por primera vez. Las épocas de reproducción concuerdan las reportadas, sin embargo 9 de las 18 especies encontradas no tenias registro de épocas de desove, para cuatro especies se desconocía tanto la época como la zona de reproducción.Tesis Bibliografía: hoja 84-89Introducción.. Antecedentes.. General.. Específicos.. Método.. Sitios de muestreo.. trabajo de campo..Trabajo de laboratorio.. Revisión de muestras.. Extracción del ADN.. Secuenciación del gen COI.. Análisis de datos.. Resultados.. Acanthurus bahianus.. Acanthurus chirurgus.. Acanthurus coeruleus.. Auxis thazard.. Calamus calamus.. Diplospinus multistriatus.. Gempylus serpens.. Haemulon plumieri.. Halichoeres bivittatus.. Halichoeres maculipinna.. Katsuwonus pelamis.. Kyphosus incisor.. Lachnolaimus maximus.. Lactophrys trigonus.. Synagrops bellus.. Synodus synodus.. Xiphias gladius.. Benthodesmus.. Caranx.. Kyphosus.. Leptostomias.. Carangidae.. Emmelichthyidae.. Sparidae.. Synodontidae.. Discusión.. Conclusiones.. Referencias.. AnexosEl uso de marcadores genéticos, principalmente el que codifica para la citocromo oxidasa subunidad I (COI, conocido como códigos de barras), además de usarse en la identificación taxonómica de las especies de casi todos los animales, ha sido eficaz para conectar las diferentes etapas del desarrollo con los adultos. En el caso de los huevos de peces es casi imposible identificarlos debido a los pocos caracteres que presentan para distinguirlos. Este trabajo tuvo por objetivo determinar el potencial de los códigos de barras para la determinación taxonómica de los huevos de peces marinos. Estos fueron colectados con una red tipo MOCNESS en el Caribe mexicano y Beliceño. En total 94 huevos fueron fotografiados; posteriormente se les extrajo, amplifico y secuencio el gen COI. Las secuencias obtenidas se compararon con otras secuencias de referencia de la base de datos Barcode of Life (boldsystems.org), y se construyó un árbol de identificación usando el algoritmo Kimura 2 Parameter (K2P) con el método del vecino más cercano (NJ), para establecer a que especie pertenecen.De los 94 huevos, se obtuvieron 67 secuencias con más de 600 pares de bases; una con 558 y otra de 354, el resto no dio resultados positivos, así se obtuvo 73.4% de eficacia de la técnica. De las secuencias obtenidas , no se observaron inserciones, deleciones, ni seudogenes. De los 69 especímenes positivos, pudimos identificar 18 especies, 18 géneros y 16 familias. Entre las especies de importancia comercial se determinaron Xiphias gladius, Auxis thazard, katsuwonus pelamis y Lachnolaimus maximus. Tambien se encontraron especies arrecifales como Acanthurus bahianus, A. chirurgus, Halicoeres bivittatus y H. maculipinna. Además aparecieron dos especies no registradas previamente en las costas de Quintana Roo y Belice, Diplospinus multistriatus y Synagrops bellus. De las 18 especies ocho no presentaban descripciones para la etapa de huevo, por lo que en este trabajo se describieron por primera vez. Las épocas de reproducción concuerdan las reportadas, sin embargo 9 de las 18 especies encontradas no tenias registro de épocas de desove, para cuatro especies se desconocía tanto la época como la zona de reproducción.Peces de arrecifesHuevosCódigos de barras de ADNÁcido desoxirribonucléico |